首先，微生物菌劑促生根的原理不同于生根劑生根粉促生根的原理。

生根劑生根粉促生根的原理：在作物生產(chǎn)應(yīng)用中有吲哚乙酸、吲哚丁酸、萘乙酸，御根生，br生根劑，復(fù)硝酚鈉等多個(gè)成分，是在植物體內(nèi)維持植物的頂端優(yōu)勢(shì)，誘導(dǎo)同化產(chǎn)物向產(chǎn)品(果實(shí))運(yùn)輸，促進(jìn)植物生根等。

微生物菌劑促生根的原理：通過(guò)施入土壤后開(kāi)始繁殖，持續(xù)分泌細(xì)胞分裂素、吲哚乙酸、赤霉素等生長(zhǎng)素及氨基酸等活性物質(zhì)改善土壤環(huán)境，間接作用于植物，并不是直接作用植物，基本適用于所有植物。促進(jìn)生根，根白、根長(zhǎng)，毛細(xì)根數(shù)量增加一倍以上，吸水，吸肥能力增強(qiáng)，莖粗、苗壯，移栽不緩苗。

其次，微生物菌劑促生根的持效期更長(zhǎng)，不僅能夠爆發(fā)式生根，還可以持續(xù)生根，且作物長(zhǎng)勢(shì)更健康。

我們都知道，生根粉的使用持效期短，且一般都有一個(gè)使用濃度范圍說(shuō)明，太低效果不明顯或者沒(méi)效果，太高不但沒(méi)有效果還可能抑制生根或引起藥害、傷根傷苗，甚至造成植物死亡。

比如，生根粉常用的主要是吲哚乙酸和萘乙酸鈉，萘乙酸本身是促主根的，吲哚丁酸是促毛細(xì)根的，但萘乙酸容易出藥害，輕者葉片卷曲，落花落葉，嚴(yán)重者直接抑制不長(zhǎng)，更嚴(yán)重的直接死苗。