農業部種植業管理司司長曾衍德講到，近些年來，東北黑土區高產作物種植面積不斷增加，大豆、雜糧等肥田作物種植面積越來越少。加之農家肥使用減少，化肥施用量增加。黑土地長期高壓、超負荷利用，在作物產量增加的同時，耕地地力和土壤微生物活性下降，土壤開始貧瘠化。
黑土是世界公認的肥沃的土壤，東北黑土區耕地面積約 億畝，是世界三大黑土區之一。有資料顯示，我國東北松遼流域，新中國成立初期，黑土層厚度平均為80－100厘米，現在大部分地區黑土層厚度已經減少到20－30厘米，并且仍在以每年1厘米的速度減少。專家已發出警告，如果不加以保護，黑土繼續退化，東北"大糧倉"的基礎不牢，優勢也會失去！
土壤生態環境的惡化會給農業種植帶來什么問題呢？農業部農技推中心首席專家高祥照博士分析道：
首先是植物生長緩慢，成亞健康態。每種植物都有適宜的pH值范圍，絕大多數植物的生長環境是微酸和微堿環境。但是土壤生態環境惡化后，植物根系無法正常的吸收和分泌物質，造成根部營養跟不上。根是植物的生長之本，根部營養的缺乏直接影響了整個植物的生長，甚至會中毒，甚至死亡。
其次是肥料利用率低，增加投入。多年過量肥料投入，土壤中已沉積了大量的磷、鉀等營養元素。再施入肥料的話不但不會被土壤吸附，反而會順水淋失流走，更加造成了土壤生態的惡化。對此山東大學教授姜遠茂也表示，由于土壤質量不斷下降，導致作物長勢不好，不明就理的農民往往會增長肥料肥量，如此一來會更加加重土壤酸根離子濃度，造成土壤環境更加惡化，形成惡性循環。
再就是容易滋生病菌，產生病蟲害。土壤生態環境惡化后會致使一些有益微生物菌群繁殖能力和生活能力下降，甚至死亡。相反會使得一些有害微生物借機大量繁殖，繼而感染植物根部蔓延全身。例如一些作物的根腐病就是因為有害微生物的入侵。
近年來，我們看到：北至內蒙古草原的馬鈴薯種植基地、南到海南島的香蕉種植園，幾乎都被各種土傳病害侵害蝕過，給農民帶來大的苦惱，也給農業種植蒙上陰影。
土壤功能退化及污染加劇，作物生長不良、病害加重、品質下降及產量降低甚至絕收等問題日益嚴重，修復土壤、保護土壤健康已經到了刻不容緩的地步！
而微生物肥料因其改良土壤和增產的功效顯著，備受關注，已成為行業發展的趨勢！
