食用菌雖然種類很多，但是栽培程序基本是一樣的，即培養料制備→滅菌或發酵→接種→發菌（有的食用菌需覆土）→出菇（耳）→收獲。有的種類只出一茬，有的可以出幾茬。 食用菌栽培與作物不同，用的不是土壤，地面只是食用菌栽培的支持物。食用菌栽培用的是培養料，食用菌要將培養料分解建造自身。這些培養料絕大多數都是人類不能作為食物直接食用的木質纖維素類的農林副產品，如秸稈、木屑和禽畜糞便等。