離子除臭工作原理是離子發生器發射出高能正、負離子，它可以與空氣當中的有機揮發性氣體分子（VOC）接觸，打開VOC分子化學鍵，分解成二氧化碳和水；對硫畫氫、氨同樣具有分解作用；離子發生器發射離子與空氣中塵埃粒子及固體顆粒碰撞，使顆粒荷電產生聚合作用，形成較大顆粒靠自身重力沉降下來，達到凈化目的；發射離子還可以與室內靜電、異味等相互發生作用，同時有效地破壞空氣中細菌生存的環境，降低室內細菌濃度，并將其完全消除。       
        空氣里的氧分子(O2)帶有輕微的磁性，生物氧空氣凈化器產生一個能場，在產生能場的過程中不會產生(UV)紫外線。當空氣通過能場時，能就被氧分子吸收，當氧分子吸收能時，它們的磁性就變得更強，使氧分子成束狀，外形似一串葡萄。我們簡稱為“氧束”。     
        這些“氧束”由多達約一百萬個氧分子組成，因此，這些氧束比一般的氧分子更為活躍。這些氧束在空氣中循環運動，提高氧氣的氧化能力，驅散香煙的煙味、尼古丁、塵粒、細菌、氣味（氨、甲硫醇、甲硫醚等）、化學氣體。污染物與這些氧束碰撞和相互作用時被中和，可氧化的氣味和化學氣體，比如一氧化碳、硫畫氫、苯、甲醛、酚和甲烷就很快地被這些氧束的作用和氧化過程有效地從空氣中去掉，污染物一般可在數分鐘內被消除。