養殖業廢水屬于含有大量病原體的高濃度有機廢水，直接排放進入水體或存放地點不合適，受雨水沖洗進入水體，將可能造成地表水或地下水水質的嚴重惡化。由于畜禽糞尿的淋溶性很強，糞尿中的氮，磷及水溶性有機物等淋溶量很大，如果不經過養殖污水處理設備的妥善處理，就會通過地表徑流和滲濾進入地下水層污染地下水。養殖污水對地表水的影響則主要表現為，大量有機物質進入水體后，有機物的分解將大量消耗水中的溶解氧，使水體發臭；當前處理養殖污水主要有厭氧消化，好氧處理工藝，其中厭氧處理效果好，可除去污水中大部分病原菌和寄生卵，且能耗低，不易發生管孔堵塞問題，污泥量少而穩定。養殖污水處理設備一體化設機，占地面積小，不需要專人管理。養殖污水的的影響：當水體中的溶解氧大幅度下降后，大量有機物質可在厭氧條件下繼續分解，分解中將會產生甲烷等有毒氣體，導致水生生物大量死亡；污水中的大量懸浮物可使水體渾濁，降低水中藻類的光合作用，限制水生生物的正常活動。養殖污水處理設備可以對此種類型的污水進行處理，使其達到排放標準。