水生美人蕉為多年生大型草本植物，株高1～2 m；葉片長披針形，藍綠色；總狀花 序頂生，多花；雄蕊瓣化；花徑大，約10 cm；花呈黃顏色、紅色或粉紅色；溫帶地區花期4～ 10月份，熱帶和亞熱帶地區全年開花；地上部分在溫帶地區的冬季枯死，根狀莖進入休眠期 ， 熱帶和亞熱帶地區終年常綠。水生美人蕉與美人蕉屬下其它種在形態和生物學特性上的區別是根狀莖細小，節間長，耐水淹，在20cm深的水中能正常生長。