輻照滅菌電子加速器產生的電子束射線具有很強的穿透力，能透過包裝直接作用于大腸菌、沙門氏菌、霉菌等細菌，直接殺死細菌，去除水產品、瓜果蔬菜糧食及制品中霉菌、黃曲霉毒素、伏馬菌素等生物毒素殺滅微生物和致病菌，減少腐爛，防止微生物污染所造成的食源性中毒事件的發生，不僅可以殺滅90%以上的細菌微生物，降解蝦仁等中殘留的霉素，就算有存活的微生物，也會因為染色體被電子束打斷而無法繁殖從而大大延長貯存期 ；馬鈴薯、大蒜等輻照還可以抑制發芽；風干食品的輻照除有效的滅菌之外還可以防蟲。大部分的食品、保健品、農副產品都可以采用輻照的辦法達到消毒滅菌、防霉、殺蟲、抑制發芽、推遲成熟、延長保質期的目的。