在辦理ISO22000之前，企業應該產品生產企業應為有明確法人地位的實體，產品有注冊商標，質量穩定且批量生產；
企業應按GMP和ISO22000管理體系的要求建立和實施了食品安全管理體系，并有效運行；
企業在申請認證前，ISO22000體系應至少有效運行三個月，至少做過一次內審，并對內審中發現的不合格實施了確認、整改和跟蹤驗證。
當企業具備了以上的基本條件后，可向有認證資格的認證機構提出意向申請。此時可向認證機構索取公開文件和申請表，了解有關申請者bi須具備的條件、認證工作程序、收費標準等有關事項。 這時認證機構通常要求企業填寫企業情況調查表和意向書等。 當然，不同的認證機構對此有不同的要求。 在正式申請認證時，申請者應按認證機構的要求填寫申請表，提交食品安全管理手冊、程序文件、SSOP、ISO22000計劃書及其他有關證實材料供認證機構文件審核。
如果覺得辦理流程麻煩的話ISO22000可以委托有企業管理咨詢公司辦理。企業只需要提供簡單的資料，配合發證單位的現場審核就可以了。審核文件和審核申請都可以交給咨詢公司處理。
流程的是1、簽訂委托合同。2、提交營業執照、組織架構圖等簡單資料。3、咨詢公司編寫審核材料。4、提交審核申請。5、發展單位現場審核。6、審核通過并頒發證書。