納豆激酶的一個顯著功能便是具有溶解血栓的作用.Mimugu F 等人用血凝塊溶解分析法涮定了納豆激酶的纖溶活性，將之同Plasmin 比較，發現納豆激酶 的纖溶活性是Plasmin的4倍; 。將納豆激酶通過靜脈注射到經化學誘導合成的血栓模型時，發現有明顯的血栓溶解，并且顯示出比纖溶酶和彈性蛋白酶更高的纖溶能力。上述研究表明納豆激酶 無論是在體外還是在體內，都表現出強的纖溶活性 納豆激酶 同時可體內的纖維蛋白溶酶原，從而使內源性纖溶酶的量有所增加。另外.健康人口服納豆激酶之后，出現以下效果:
① 明顯地縮短了優球蛋白的溶解時間(ELT);
② 血漿中的纖溶活性提高;
③ 血漿中t-PA量有所增加。由于NK 的安全性，穩定性和良好的溶解血栓的作用，其有可能作為口服試劑用于血栓治療。