睡蓮的種植方法多采用分株種植。耐寒種通常在早春發芽前3-4月進行分株，不耐寒種對氣溫和水溫的要求高，因此要到5月中旬前后才能進行分株。分株時先將睡蓮根莖挖出，挑選有飽滿新芽的根莖，切成8~10cm長的根段，每根段至少帶1個芽，然后進行栽植。頂芽朝上埋入表土中，覆土的深度以植株芽眼與土面相平為宜，確保睡蓮不會浮出水面。種植前期水位不易太深，30厘米左右即可，這樣有利提高水溫；等到發芽后再逐漸提高水位。
睡蓮的種植密度不是固定的，根據種植密度和種植品種株型大小而定。以觀賞為目的的種植，要求讓品種能充分展現它的特征，其花、葉能自然舒展在水面上讓人們能欣賞到睡蓮花的芬芳和葉片的優雅。這種情況下，我們不要種植密度過大，防止葉片相互重疊簇立出水面。建議每畝種植800棵。