紅葉小檗是日本小檗的自然變種。落葉灌木。幼枝淡紅帶綠色，無毛，老枝暗紅色具條棱；節間長1-1.5厘米。葉菱狀卵形，長5-20（35）毫米，寬3-15毫米，先端鈍，基部下延成短柄，全緣，表面黃綠色，背面帶灰白色，具細乳突，兩面均無毛。花2-5朵成具短總梗并近簇生的傘形花序，或無總梗而呈簇生狀，花梗長5-15毫米；小苞片帶紅色，長約2毫米，急尖；外輪萼片卵形，長4-5毫米，寬約2.5毫米，先端近鈍，內輪萼片稍大于外輪萼片；花瓣長圓狀倒卵形，長5.5-6毫米，寬約3.5毫米，先端微缺，基部以上腺體靠近；雄蕊長3-3.5毫米，花藥先端截形。漿果紅色，橢圓體形，長約10毫米，稍具光澤，含種子1-2顆。