復合土工膜自身的連接，防滲薄膜的連接方式可歸納為三種，即粘結法、焊接法以及*法，視防滲薄膜的原材料的不同而選擇，所有連接縫的抗滲性能均應進行檢查，以防接縫連接不好而滲漏。
復合土工膜與周邊邊界的連接。復合土工膜與周邊邊界必須嚴密結合，施工時可在地基和岸坡開挖錨固槽連接，如果地基是淺層砂礫石透水層，則應將砂礫石開挖掉，直至基巖然后澆筑混凝土底座，將土工膜固定在混凝土內，如果地基是不透水粘水層，可開挖深為2m，寬為4m左右的錨固槽，將土工薄膜置于槽內，然后密實回填粘土；如果地基是深厚的砂礫石透水層，可采用土工薄膜鋪蓋的方式進行防滲，其長度根據計算確定，鋪蓋部位必須整平，并鋪設厚約30cm，大粒徑為20mm的過渡層，同樣膜上也要鋪設過濾層，隨后加設保護層，薄膜周邊應與兩岸岸坡不透水層嚴密結合，防滲薄膜與錨固槽的連接視薄膜與混凝土的允許接觸滲透坡降確定。聚氯乙烯和丁基橡膠類薄膜可用粘合劑或溶化劑很好的粘著于混凝土面上，故嵌入長度適當可短些，因聚乙烯薄膜不能粘著于混凝土面上，故嵌上混凝土的長度至少為 。
復合土工膜鋪設完成后，應盡量減少在膜面上行走、搬動工具等，凡能對防滲膜造成危害的物件，均不應放在膜上或攜帶在膜上行走，以免對膜造成意外損傷。
薄膜層即土工膜層，它是防滲結構的主體，應滿足施工和運行期間承受的應力要求，由于土工膜的防滲效果與膜的強度和厚度有關，因此，要根據設計應力選擇適當的厚度，除施工應力外，土工膜防滲層運行期間承受的應力主要來自地基的不均勻和局部沉陷及其他異常現象，如地基中出現孔洞和滑動等。
土工膜的設計厚度還與支持層的材質和形狀有關，例如，砂質土支持層的粒徑越大和有棱角，則所需厚度就越大。
膜面一側或兩側與土工織物復合為一體的復合土工膜，由于其整體強度比較高，抗撕裂，抗頂破，抗刺破能力比較強，復合在膜面上的土工織物實際上就起了支持，保護作用。
因此，對于采用復合土工膜的防滲結構，在一般情況下，過渡層和膜后支持層皆可簡化，即在膜上直接鋪設混凝土護面或由碎石墊層與混凝土板塊，干砌石和漿砌石等構成的護面，膜后則可直接鋪設中粗砂墊層或直接與壩身土工膜土體接合。