實驗室系統工程主要指的是：實驗室整體規劃設計系統、實驗室裝修系統、實驗室家具系統、實驗室通風系統 、實驗室廢水、廢氣系統 、實驗室供氣系統、實驗室潔凈系統。
實驗室的裝修大體上和普通工裝類似，主要在于：水、電、風、材料、工藝、流程等特殊的施工和選擇。
水路：實驗室的用水一般是：普通自來水、蒸餾水也就是三蒸水、超純水也就是離子水。上水的施工要考慮的是安全和科學還有適用。走上水時，要根據具體實驗來選擇材料也就是上水管和接頭。還要考慮水電的分離、水管周圍的環境、水路的走向等等。實驗室的下水一般比較麻煩，因為實驗室的下水規范要求和實際國情，還有具體的實驗室或實驗樓環境有很大的出入。實驗室的下水大體上可分為：污染水和低污染水，低污染水一般指莫些設備的冷凝循環水和洗滌莫些容器的廢水等。污染水的范圍很多一般有，腐蝕性的水，如酸、堿腐蝕水，有機物腐蝕水，無機物污染水，還有重金屬污染水等。 電路：實驗室的用電是一項很重要的問題，弱電、照明電、安全電和實驗設備用電。
其中實驗室儀器設備用電為主要 ，因為實驗室的儀器設備特別是一些精密儀器，這些儀器設備的原理大都是洛倫茲力原理的作用和反作用，也就是通過電流的微變化，來控制數據的變化。實驗室儀器設備用電，我們所要解決的問題就是，控制和降低電流的變化浮動、減少或穩定諧波的變化數值、減少或降低磁場的干擾等等。如電的問題解決不了，嚴重的會造成災難，一般的會造成儀器的損害、實驗的數據不準確或不穩定、儀器的使用壽命減低等等。 排送風：實驗室的排風主要是解決實驗人員的安全和實驗室環境的需要。實驗室的排送風主要是考慮什么環境需要正壓和負壓還有恒壓。
具體的配置要看，實驗室的具體性質，來安排正負壓的大小。實驗室的排送風，不像普通的辦公換風。它的風路和引導氣體走向有很嚴格的要求，解決不好就會產生氣體回流及氣體排不出去，或排風量很大實驗室內氣味仍然存在，達不到換風的效果。
實驗室的具體性質不同，所要求的正負壓不同，風量和換風次數也不同。實驗室的具體性質不同，所要達到的相對換風和 換風也是有著很大的差異。 實驗室的材料選擇也很重要，要根據不同的實驗性質，來選擇不同的材料去適應實驗室特殊的環境。如腐蝕也要看是酸性的，還是堿性，還是有機物的。當然還要考慮到實驗室的高溫和低溫環境。