在制藥廠潔凈車間裝修中設計裝修都是非常重要的，在藥廠建設中我們應該注意以下這些問題。一就是潔凈廠房的設計、二是潔凈廠房凈化空調系統的設計。
1、潔凈廠房的設計裝修
在十萬級凈化車間的藥廠內，為了保持藥品生產潔凈車間的衛生，操作人員還會利用氣流氣壓來打造一個緩沖間，保護潔凈車間的潔凈環境。這個緩沖間位于潔凈車間和走廊之間，緩沖間通往潔凈室和走廊的門不可以同時打開避免了雙方空氣的交叉污染。
2、空氣凈化系統
打造一個合乎標準的藥廠潔凈車間不僅投資大，而且運行費用也不容小覷。一般來說，在藥品生產車間內，除了需要做到消毒殺菌，就連空氣都需要達到凈化標準。除此之外，藥廠潔凈車間在建造時還需要配備廢水治理設備和管道、消防系統、供配電系統、自控系統、真空清掃系統等等。
制藥廠房設計規范之工藝布局：工藝布局應符合生產工藝流程及空氣潔凈度等級的要求，并應根據工藝設備安裝和維修、管線布置、氣流流型以及凈化空調系統等各種技術措施的要求綜合確定。
潔凈室的主要項目施工流程：
放線測量→潔凈室地面找平處理→實驗排風管道安裝→潔凈室圍護結構安裝→潔凈室天花安裝→潔凈室PVC地板施工→實驗安具安裝→通風設備及風口安裝→設備調試→全系統測試
在制藥廠凈化車間中工作人員需要衣著相關無塵服、無塵帽、無塵鞋等，頭發不得外披、指甲不得過長等。