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畜禽糞便的高溫好氧發酵過程實際上就是畜禽糞便中的微生物發酵的過程。 不溶性大分子有機物先附著在微生物外，由微生物所分泌的胞外酶分解為可溶性小分子物質，再送入微生物細胞內被利用，而堆體基質的形態復雜，只有分解為簡單形態才能為微生物利用。 例如： 蛋白質的分解過程是： 蛋白質--胨--肽--氨基酸--氨化物--細菌原生質、氮氣或氨氣 碳水化合物的分解過程是: 碳水化合物--單糖--有機酸--二氧化碳、細菌原生質。 通過微生物的生命活動合成及分解過程，把一部分被吸收的有機質氧化成簡單的無機物，并提供生命活動所需要的能量；同時把另一部分有機物轉化合成新的細胞物質，使微生物增殖。當分解速度緩慢下降，釋放的熱量逐漸減少時，堆溫也逐漸下降。 發酵設備簡介及特點： 畜禽糞便好氧發酵設備主要由發酵室、主軸攪拌系統、液壓動力系統、上料提升系統、自動出料系統、高壓送風系統、除臭換熱系統和自動控制系統組成。 1、主體均采用雙層保溫設計，設備內膽與物料接觸面材質為304不銹鋼。 2、主軸攪拌系統主要作用是通過主軸轉動拋翻物料，使物料具有較好的疏松透氣性。 3、除臭換熱系統通過濕法噴淋或化學法對發酵后排出的氣體進行收集處理達標后排放，避免對周圍環境的二次污染；同時將廢棄熱量收集再利用以達到降低能耗的目的。 4、自動化控制系統智能高溫好氧發酵控制系統自動化程度高，配有溫度傳感器、電輔加熱裝置(罐內進風溫度調整至發酵溫度)等；同時關鍵部件設計有針對性保護（當設備發生不正常情況時及時報警停機以降低設備的損壞）。