線性離子阱質譜儀為常規結構解析提供多種解離技術。PQD是消除低質量截止效應的技術。廣泛應用于可預測和不可預測代謝物的檢測，并可以使用同重元素標記法進行肽定量分析。


主要應用：
1、應對代謝物鑒定和確證，線性離子阱質譜儀可自動查找到所有可能的代謝物。
2、基于離子/離子化學的電子轉移解離，線性離子阱質譜儀是實現此技術的儀器。ETD與CID互為補充，提高蛋白序列覆蓋率；保護不穩定PTM翻譯后修飾基團，簡化數據分析；單次進樣自動啟動CID和ETD。
3、母離子智能選擇：自動數據依賴多級質譜采集技術不僅能為用戶提供預測代謝物結構信息，也能提供提供未預測的代謝物結構信息。此外，使用自動固定中性丟失數據依賴性掃描觸發三級質譜掃描能檢測某一類的代謝物。使用MetWorks和MassFrontier分析軟件增強復雜基質鐘代謝物篩選和鑒別功能，使譜圖解析更加簡便。
4、應對蛋白質組學和生物標記問題，ETD解離技術使LTQ XL成為蛋白質組學研究更Q大的分析工具。


線性離子阱質譜儀的功能簡介：
1、可升級的電子轉移裂解（ETD)模塊可以提供傳統裂解方法無法得到的蛋白質翻譯后修飾信息；
2、脈沖碰撞能量誘導解離（PQD)功能可以提供低質量端碎片離子信息；
3、自動數據依賴性多級質譜采集技術不僅為用戶提供預測代謝物結構信息，也能提供未預測到的代謝物結構信息。此外使用自動固定中性丟失數據依賴性掃描觸發三級質譜掃描能檢測某一類的代謝物。使用MetworksTM 和Mass Frontier分析軟件增強復雜基質中代謝物篩選和鑒別功能，使譜圖解析更簡便。


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