用微生物的代謝作用去除廢水中有機污染物。根據文生物的代謝種類分為厭氧型和好氧型兩種方法。具體方法有：活性污泥法、生物膜法、氧化塘法和污泥消化等。厭氧法處理高濃度有機廢水優點：有機物負荷高；污泥產率低，產生的污泥易于脫水；營養物需要量少；不需曝氣，能耗低；產生沼氣；水溫適宜范圍廣；活性厭氧污泥保存時間長等。與傳統生化法相比還可省去二沉池，減少了工程的占地面積，污泥排放量少，運行費用低且自動化程度高。