滴灌系統(tǒng)施肥，一方面由于可溶肥隨著水直接施入作物根系密積區(qū)，作物棵間空地上無任何肥料浪費。另一方面滴灌是以小流量滴水的形式滲入根區(qū)，非常容易控制。水、肥均不會有深層淋洗浪費。滴灌施氮，肥效可達74%，而傳統(tǒng)施法不會超過30%。
采用滴灌系統(tǒng)施肥的缺陷是有可能堵塞滴頭。肥料需要是可溶的，不可溶的肥會迅速堵塞滴頭。肥料原料之間化學反應(yīng)還會產(chǎn)生沉淀，時間一長，沉淀物會堵塞滴灌系統(tǒng)。
利用滴灌系統(tǒng)施肥，要認真研究肥料的溶解性。不溶、溶解度低、或在某種條件下易發(fā)生反應(yīng)而形成沉淀的肥料均應(yīng)該避免選用。
大部分固態(tài)化肥包衣。為了避免包衣對滴灌系統(tǒng)產(chǎn)生堵塞，盡量選取少量樣品放入溶解罐中攪拌，然后觀察包衣的溶解情況。如果溶解后包衣物質(zhì)沉淀到罐底，在施用時，讓注肥器吸取上層溶液，不要攪動肥料溶液整體。