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雜交玉米種子的選育就是將自交系或其他優良親本材料組配成雜交組合，通過測交鑒定、品種比較和各類品種比較試驗選育出符合育種目標要求的強優勢雜交種：
1、雜交玉米種子的自交系選育：自交系的選育已經為雜交種選育提供了大量參考資料和信息。在應用一組優良自交系選育雜交種之前，需要對所使用的親本有較詳細的了解，并遵照某些原則在親本間組配：親緣關系遠，地理差異大，例如采用國外系x國內系的組配模式已經被國內育種家廣 泛認識。類型有差異，性狀要互補，類型間的差異通常反應了基因型的差異，性狀互補更加重要，特別是重要的抗性性狀，至少在親本之一中要存在。農藝性狀和種子生產性能好，這對于新雜交種的應用極為重要。配合力要高，這是相當基本的條件之一，特別是產量性狀的配合力要高。
2、雜交玉米種子的選育技術簡單：單交種的組配除了育種者根據自己的經驗選配親本之外，通常采用相當多的方法有兩種：
①輪配法：單交組合數＝P（P－1）/2，其中的P為親本數。
②骨干系法：單交組合數＝M×N，即將自交系分為M、N兩組。在組間做可能的雜交，其中一組為骨干自交系組成，另一組為新自交系組成。這種方法通常相當為有效。
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