工業醫院專用潔凈設備的運作是通過三個相互聯系的系統：
機房醫院專用潔凈設備主要由六部分組成：
1.控制監測系統
控制系統通過控制器顯示空氣的溫、濕度，空調機組的工作狀態，分析各傳感器反饋回來的信號，對機組各功能項發出工作指令，達到控制空氣溫、濕度的目的。 　　
2.通風系統 
機組內的各項功能(制冷、除濕、加熱、加濕等)對機房內空氣進行處理時，均需要空氣流動來完成熱、濕的交換，機房內氣體還需保持 流速，防止塵埃沉積，并及時將懸浮于空氣中的塵埃濾除掉。 　　
3.制冷循環及除濕系統
制冷循環：利用制冷劑蒸發時吸收汽化潛熱來制冷。
除濕系統：一般利用其本身的制冷循環系統，采用在相同制冷量情況下減。
4.加濕系統 　　通過電極加濕罐來實現。
5.加熱系統 　　加熱做為熱量補償，大多采用電熱管形式。
普通空調用于機房造成的故障結果：
1.普通空調無法保持機房溫度恒定會造成電子元氣件的壽命大大降低。
2.無法保持機房溫度均勻，局部環境容易過熱導致機房電子設備突然關機。
3.無法控制機房濕度，機房濕度過高會產生冷凝水，導致微電路局部短路。
4.無法控制機房濕度，機房濕度過低會產生有破壞性的靜電，導致設備運行失常。
5.風量不足和過濾器效果差，機房潔凈度不夠灰塵的聚集造成電子設備散熱困難，容易過熱和腐蝕。
6.普通空調設計選材可靠性差空調維護量大，壽命短。
機房精密空調對于機房的作用：
1.保持溫度恒定(溫度波動控制在24±1～2oC之內)。
2.保持濕度恒定(相對濕度波動控制在50％±5% RH之內)。
3.空氣潔凈度 微米/升<18,000。即在每升的空氣中，大于等于 微米的顆粒應小于18,000個。
4.換氣次數/小時>30。即在給定的機房內，空調的風量和機房容積的比值大于30。
5.機房正壓>10Pa。
6.空調設備具備遠程監控及來電自啟動功能。
　 對于機房來講，要保證機房的環境穩定可靠，需要機房專用空調來實現，使用普通空調機組僅僅是減少了初投資，但無法保證機房要求的溫濕度環境，總的費用也高于機房專用空調；只有機房恒溫怛濕空調機組才能解決機房可靠地運行