潔凈室實驗室是一個全密閉的環境，通過空調送、回風系統的初、中、高效過濾器，使室內環境的空氣不斷地循環過濾，以保證空氣懸浮粒子濃度受控到一定的濃度，潔凈室實驗室需控制的主要參數有塵埃粒子數、菌落數、換氣次數、壓差、溫度、濕度、光照度、噪音。常見的潔凈實驗室有細胞培養室、動物實驗室、植物實驗室等，根據實驗的需要，對環境的潔凈度、溫度、濕度及空調的工作時間有不同的要求；為了實現節能的目的，對于動物飼養室、培養室等間斷工作的房間，需要配備獨立的空調機組及備用電源。
  實驗室空調系統須滿足實驗室研究要求，除對溫度、濕度需嚴格控制外，需要足夠的通風量處理煙塵、異味、空氣中污物，滿足排風設備通風以及實驗室內熱負荷要求，空調系統須充分考慮系統的可靠性并考慮富余量；不同性質區域需保證不同的相對壓力，并要根據相關標準考慮節能。實驗室須保持一定的溫度梯度和氣流狀況，通常情況下實驗室相對于走廊以及非實驗室區保持負壓，氣流從低危區流向高危區，整棟建筑相對外界須保證正壓以防止有害的未經過濾處理的氣體滲入。走廊的送風需考慮到對實驗室的補風以及整棟建筑的正壓要求，在建筑平面布局合理的前提下，充分考慮送風口、回風口以及排風口的位置，送回排風量的匹配，建立房間之間合理的壓力梯度，保證空氣有序流動，防止交叉污染。
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