城市污水由生活污水和工業廢水組成，它的成分是及其復雜的。所以，污水源熱泵經常會出現下列問題： （1）污水流經管道和設備（換熱設備、水泵等）時，在換熱表面上易發生積垢、微生物貼附生長形成生物膜、污水中油貼附在換熱面上形成油膜、漂浮物和懸浮固體物等堵塞管道和設備的入口。其最終的結果是出現污水的流動堵塞和由于熱阻的增加惡化傳熱過程。 （2）污水引起管道和設備的腐蝕問題，尤其是污水中存在使管道和設備腐蝕生銹的物質。 （3）由于污水流動阻塞使換熱設備流動阻力不斷增大，引起污水量的不斷減少，同時傳熱熱阻的不斷增大又引起傳熱系數的不斷減小。基于此，污水源熱泵運行穩定性差，其供熱量隨運行時間延長而衰減。 （4）由于污水的流動阻塞和換熱量的衰減，使污水源熱泵的運行管理和維修工作量大，例如，為了改善污水源熱泵的運行特性，換熱面需要每日水力沖洗3~6次。