1、注入燃料，接通電源，啟動助燃開關，爐內溫度達到自燃溫度，將病害畜禽肉尸及其產品投入爐內，關閉助燃開關，啟動自燃開關，病害肉體保持自燃狀態不能剖割的病害畜禽整體投入焚燒爐中，啟動自燃開關，自燃至完全碳化為止。 2、整尸焚毀：不能剖割的病害畜禽整體投入焚燒爐中，啟動自燃開關，自燃至完全碳化為止。 3、肉尸分割焚毀：允許分割的病害肉品分割后投入焚燒爐中，啟動自燃開關，肉塊自燃至完全碳化為止。 4、臟器焚毀：病害畜禽臟器整體投入焚燒爐中，啟動助燃開關，使臟器在助燃狀態下燃燒至完全碳化為止。 5、焚燒后的碳化物需要選擇地點（遠離水源地和居民區）進行掩埋，徹底杜絕病菌的傳播。