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透明軟骨染色方法，特殊染色，簡稱特染，是在HE染色的基礎上發展起來的染色技術，是臨床病理診斷中重要的輔助技術之一，許多在常規HE染色難以診斷的疾病，通過特殊染色和組織化學染色可以進一步確診，有助于提高臨床病理診斷水平。 在觀察組織細胞形態改變時，特殊染色既能觀察到其組織成分的變異，又能對HE染色中看到的組織或細胞內某些相似物質或結構（如膠原纖維、色素或空泡等）進行鑒別以及區別病灶中的病原體等問題。經過先輩不懈努力，先后創建了含鐵血黃素染色、結核菌抗酸染色、膠原纖維和肌纖維的Van Gieson染色及脂肪染色等。 組織化學染色是把組織學、細胞學和生物化學結合在一起的一門染色技術，應用某些試劑或化學染料與組織細胞內的化學成分進行特異性反應或染料分子結構的某些基團與組織內的相應基團特異性結合而顯色，既能確定組織細胞的某些特殊成分，又能顯示出這些特殊成分在組織細胞中的分布和含量以及在病變時所發生的變化。例如顯示肝糖原的高碘酸-無色品紅（糖原PAS）染色法，組織切片先經高碘酸氧化，使組織中含有己糖結構的碳鍵打開，生成二醛，后者與無色品紅/雪夫結合呈陽性反應，形成紫紅色顆粒狀復合物，可以用消化法做對照可以確定是否真的為糖原物質。因此，PAS染色可以確定肝細胞內糖原的存在，通過觀察糖原的分布和含量以及變化，可了解肝細胞的功能狀態。因此，蛋白質、糖類、核酸、色素、某些金屬鹽和脂肪等特殊染色以及各種酶類的顯色反應都屬于組織化學染色技術。 幾乎所有組織都可以用冰凍切片進行染色，多數組織可以通過石蠟切片進行染色，但是脂肪和酶類通過冰凍切片染色，因為脂肪組織溶于乙醇二等有機溶劑，而石蠟切片的前提就是需要用乙醇和二處理；酶的染色是因為酶的活性一般在37℃有活性， 但是石蠟包埋的溫度都在60℃左右。 特染染色的簡易步驟參考如下：組織固定-包埋切片-切片用脫蠟至水-蘇木素染色-鹽酸乙醇分化-藍化液返藍-伊紅染色-梯度乙醇脫水-透明液透明-中性樹膠封片。骨組織除了常規的操作步驟還需要進行脫鈣處理才能進行包埋切片等后續步驟。 注意事項： 1、切片脫蠟應盡量干凈；系列乙醇應經常更換新液。 2、鹽酸乙醇分化時間應根據切片厚薄、組織類別以及新舊而定，另外分化后自來水沖洗時間應該足夠，以便清洗酸。 3、冷凍切片染色時間盡量要短。

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